使用 HoloViews 绘制和弦图
- 首先，请确认您正确安装了
HoloViews。
- 如是，上述环境中应该已经正确安装了
ipykernel —— 这样，您就可以在 vscode 中使用 jupyter notebook 实时查看 HoloViews 画出的成图。
- 在文件夹内新建
holochord.ipynb ，开始绘制和弦图。
导入所需的包
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import holoviews as hv
from holoviews import opts, dim
import bokeh.sampledata
bokeh.sampledata.download()
from bokeh.sampledata.airport_routes import routes, airports
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准备所需的数据
理解和弦图
- 和弦图描述事物之间的联系。
- 圆周上的一段弧表示一个事物；弧长越长，说明该事物和其他事物之间建立的联系数量越多。
- 圆内的每一条细线表示一个联系，我们看到的色带实际上是细线密集排布后形成的。
理解和弦图背后的数据
- 事物之间的联系可以类比为一个向量。
- 它有起点、有终点，有联系的“强度”（也可以理解为数量）。
- 为了绘制一幅和弦图，我们需要提供一份包括待研究事物、及这些事物之间**联系(links)**的数据：
- 横向上看，每一条联系由
source, target, value 组成，对应联系的“源”“流”“值”；
- 纵向上看，存在若干条联系；
- 因此，为了描述这些联系(即画出圆周内的部分)，我们需要准备的数据，仅仅是一个 n 行 3 列的表；此外，为了画出圆周上的弧，我们还需要提供一份事物的名单。
理解之后，开始准备我们的数据
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route_counts = routes.groupby(
['SourceID', 'DestinationID']
).Stops.count().reset_index()
nodes = hv.Dataset(airports, 'AirportID', 'City')
chord = hv.Chord((route_counts, nodes), ['SourceID', 'DestinationID'], ['Stops'])
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问答时间
Q: 这里用的是包自带的数据集，如果我想给自己的数据做可视化，那么我应该如何准备数据呢？
A: Excel yyds！将上面提到的两份表在 Excel 中准备好，使用 python 必学的数据处理包 pandas 中的一行命令，将 Excel 中的数据读入就可以了~
Q: 在 Excel 里准备这样两张表似乎挺麻烦的，因为常见的表不一定会以“起点-终点-联系数量”的形式来组织，那么如何给这些数据做前处理，让数据乖乖以 n 行 3 列的形式组织起来呢？
A: 这个只要简单学一下 pandas 就可以了，很简单的，真的。
绘图
- 绘图需要做的，就是选择你关心的部分，命令
HoloViews 帮你绘图。
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busiest = list(routes.groupby('SourceID')
.count()
.sort_values('Stops')
.iloc[-20:]
.index
.values)
busiest_airports = chord.select(AirportID=busiest, selection_mode='nodes')
busiest_airports.opts(
opts.Chord(
cmap='Category20', edge_color=dim('SourceID').str(),
height=800, labels='City', node_color=dim('AirportID').str(), width=800
)
)
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